A Rede Natura 2000 é uma rede ecológica europeia que resulta da implementação de duas diretivas comunitárias essenciais: a Diretiva Aves e a Diretiva Habitats - transpostas para o direito interno pelo Decreto-Lei n.º 140/99, de 24 de abril, na redação dada pelo Decreto-Lei n.º 49/2005, de 24 de fevereiro, alterado pelo Decreto-Lei n.º 156-A/2013 de 8 de novembro. Esta rede supranacional abrange áreas designadas como Zonas Especiais de Conservação (ZEC) e Zonas de Proteção Especial (ZPE).

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A propriedade Santo Isidro está completamente inserida na Rede Natura 2000, sendo parte integrante das ZEC e ZPE. Além disso, é reconhecida como um Sítio de Interesse Comunitário (SIC), conforme estipulado pela convenção RAMSAR.